Подсистема InvoCard изначально проектировалась как форматно независимая система. Поэтому в ее состав включен специальный интерфейсный модуль, который позволяет легко настраивать систему на  использование форматов любых других фронт-офисов и процессинговых центров. Это достигается благодаря тому, что подсистема содержит собственную базу данных по форматам файлов, которые генерируются внешними по отношению к ней центрами обработки операций по картам. Специальный интерфейс позволяет быстро описать новый файл достаточно сложной структуры и таким образом включить его в обработку в качестве входного файла для программного комплекса InvoCard. Кроме того, в существующей реализации система обрабатывает файлы следующих процессинговых центров:

• ПЦ КардЦентр
• ПЦ ТрансКредитКард
• ПЦ РУКАРД
• ПЦ Гута-Банка
• ПЦ Газпромбанка (старые и новые)
• ПЦ Union Card
• ПЦ UCS
• ПЦ Петрокоммерцбанка
• ПЦ Мастербанка
• ПЦ Внешэкономбанка
• ПЦ УралСибБанка
• ПЦ Зенита
• ПЦ ИмпэксБанка
• ПЦ "Общая карта"
• ПЦ  МДМ Банка
• ПЦ  Банка Москвы
• ПЦ  ЭкспоБанка
• ПЦ  Банка Славянский
• ПЦ Межпромбанка
• ПЦ Межпромбанка
• ПЦ Банка Славянский
• ПЦ МБРР
• ПЦ Экспобанка
• ПЦ Сбербанка
• ПЦ SMАRTPAY
• ПЦ STB CARD
• ПЦ АЗЕРИКАРД

Программный комплекс InvoCard так же может взаимодействовать с любыми процессинговыми центрами на базе TRANSMASTER, TPII (старый и новый), MAGIX, COMPASS+, OPENWAY (всех версий), SMARTVISTA, BASE24 на уровне файлов стандартных форматов.